桂電新聞

我校生物信息研究團隊在SCI一區期刊發表高水平學術論文

作者: 时间:2019-09-10

近日,我校计算机与信息安全学院生物信息研究室张艳菊老师团队2017级硕士研究生余莎同学的论文“PeNGaRoo, a combined gradient boosting and ensemble learning framework for predicting non-classical secreted proteins”,在生物信息类顶级期刊《Bioinformatics》在線發表(https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btz629)。

該論文對革蘭氏陽性菌的非經典分泌蛋白進行了系統分析與建模,從蛋白質序列結構、物理化學性質以及遺傳信息等角度全面地進行特征提取,提出了基于粒子群優化的參數優化算法來解決LightGBM機器學習方法多參數調參優化的問題,引入了雙層集成模型策略提高了預測的准確性,並以此爲基礎開發了一個穩定的、高效的、精准的革蘭氏陽性菌非經典分泌蛋白預測的服務器(http://pengaroo.erc.monash.edu/)。該項研究得到國家自然科學基金(61862017)、廣西自然科學基金(2018GXNSFA1313117,2016GXNSFCA380005)和桂林電子科技大學研究生優秀論文培育項目(17YJPYSS14)的資助。

據悉,《Bioinformatics》是牛津大學出版社旗下生物信息學和計算生物學領域的頂級期刊,該期刊在中科院SCI分區小類(生化研究方法、生物工程與應用微生物、數學與計算生物學)中屬于一區top期刊,最新一年的影響因子爲4.531。

(供稿:计算机与信息安全学院 张艳菊 审稿:宣传部)

版權所有:桂林電子科技大學 校址:中國廣西桂林金雞路1號
桂ICP备 05000961号 桂公網安備45030502000232號
電腦版